Tras el final de suspense de la primera temporada, Dutch, Johnny y D’avin empiezan con fuerza la segunda temporada para desvelar los planes secretos de Khlyen, el traicionero y misterioso mentor de la infancia de Dutch. A medida que se revelan verdades impactantes, Dutch, D’avin y Johnny se dan cuenta de que los famosos criminales del Quad no pueden hacer frente a la amenaza que supone la Coalición de Detención y Recuperación (RAC).
Luego de no poder rescatar a D’avin de Arkyn, Dutch y Johnny se dirigen a Eulogy, una ciudad de trueque sólo para bandidos, con la esperanza de robar un misterioso escudo de alta tecnología de la infame banda Connaver.
Con D’ Avin de nuevo en el equipo, los Killjoys regresan a las ruinas de la Ciudad Antigua para cazar ocho convictos que escaparon pero pronto descubren que su némesis más peligroso es el fijador de la compañía que em...
Una misión de rescate en Badlands va mal cuando los Killjoys se encuentran con un enemigo inesperado en una mina abandonada.
Una sencilla misión de escolta toma un giro alarmante cuando los Killjoys descubran que los estudiantes han desaparecido misteriosamente de una escuela para niños superdotados en Westerly.
Johnny acompaña a Pawter a su hogar para una fría reunión familiar, mientras que D’ av experimenta efectos secundarios sorprendentes de los experimentos de Khlyen en Red 17.
La búsqueda de Dutch del misterioso plasma verde pone al equipo a merced de un excéntrico coleccionista galáctico.
El equipo es puesto a prueba hasta el límite aunque las tensiones aumentan mientras Dutch interroga a un letal agente de Nivel Seis que capturó y Johnny investiga en secreto el muro de Jelco para Pawter.
La señal de Khlyen en Red 17 conduce a Dutch, D’ Avin y Alvis a un centro de investigación sobre Arkyn; Johnny y Pawter tratan de conseguir apoyo para la inminente guerra de West erly.
Dutch termina siendo capturada por una multitud enfadada como resultado del plan de Pawter de liberar a Ciudad Antigua del dominio de Jelco.
Los Killjoys y un viejo enemigo unen sus fuerzas en un intento desesperado para frustrar los planes de los Nivel Seis para el Quad.