Durante el mes de octubre de su tercer año en la escuela secundaria, Koyomi Araragi conoce a una estudiante de intercambio llamada Ougi Oshino gracias a Kanbaru Suruga. Ougi le dice a Araragi que hay algo que desea consultarle. Cuando ella dibuja el mapa de la escuela Naoetsu, ella encuentra algo peculiar. Este descubrimiento revela una historia que no estaba destinada a ser contada y esto hace la vida escolar de Araragi totalmente diferente. Esta es la historia que saca a la luz "de qué está hecho" Koyomi Araragi. Esta es la historia que revela el "principio" de todo.
Koyomi y Ougi se encuentran atrapados en un aula, y la historia vuelve al punto en que Suruga le presenta a Ougi a Koyomi. Ougi se acerca a él con un misterio sobre una habitación que no se ve en los planos de la escu...
A raíz del día anterior, Araragi está a punto de ingresar a su salón de clases cuando Hanekawa le informa que un estudiante que estuvo ausente todo el año finalmente asistirá. La historia se adentra más en el pasado, ...
Habiendo redescubierto la habitación en el segundo piso de la casa en ruinas, Koyomi le cuenta a Ougi de los eventos que sucedieron allí cinco años antes.
Hanekawa revela sus preocupaciones sobre Ougi mientras ella y Araragi van a visitar a Oikura.
Araragi y Hanekawa visitan Oikura y conocen la dolorosa historia del pasado de su familia.
Ougi afirma haber descubierto el paradero de la madre de Oikura y, a su manera, ayuda a Araragi y Hanekawa a resolver el misterio.
Koyomi Araragi espera en las ruinas de la escuela intensiva para pedir ayuda a Suruga Kanbaru, una solicitud que él espera que ella rechace.
Después de una salida apresurada de las ruinas de la escuela intensiva, Koyomi y Suruga se dirigen hacia el lugar de reunión, solo para encontrar algunas dificultades en el camino.
Habiendo llegado finalmente al lugar de encuentro, Koyomi y Suruga encuentran a una persona inesperada esperándolos. ¡Antes de que su reencuentro pueda tener lugar, deben enfrentarse a un enemigo inesperado!
El grupo se traslada al Santuario del Norte de Shirahebi, donde Izuko Gaen les cuenta la historia detrás de la ubicación y el efecto que tuvo el primer esbirro de Shinobu en ella.
Koyomi se enfrenta al primer secuaz de Shinobu, el asesino de apariciones original. Pero en lugar de iniciar una batalla, el samurái hace una simple petición.
Mientras Koyomi se prepara para su duelo, se entera de la crisis que enfrenta Hanekawa y debe decidir qué batalla debe pelear.